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《公共科学图书馆·计算生物学》:已解码微生物有新识别方法

2007-6-4 08:55:09
来源:华文生技网




细菌及病毒一直以来都是威胁人类最大的病源,而近年来这个威胁更是有增无减,只要有相关的病源菌DNA序列,利用已解码的基因组快速分析病源菌的种类,已经不再是梦想。目前已有数百种的细菌及病毒的基因组(genome)序列被解开,可通过这些DNA序列的分析快速判别各种微生物,美国马里兰大学的Adam Phillippy教授开发了一个电脑软件,名为Insignia,可以通过由细菌或病毒特有的DNA来识别各种已解码的微生物。

研究人员表示Insignia是使用高效率的演算法,将已知的病毒或细菌的基因组进行比对,然后再将这些比对结果贮存于资料库。这个程式也具有广泛的应用性,从诊断人类是否遭受感染到检验水系统的病菌等,都派得上用场。到目前为止,Insignia已成功的分析46种弧菌属的细菌,并刊登于5月份的《公共科学图书馆·计算生物学》(PLoS Computational Biology)期刊。更多关于Insignia的相关信息可参考以下网址:http://insignia.cbcb.umd.edu。